经过多年的建设，清华大学已基本形成了综合性的学科布局，截至2025年，共有一级学科博士硕士学位授予点69个，一级学科硕士学位授予点1个，分布在哲学、经济学、法学、教育学、文学、历史学、理学、工学、医学管理学、艺术学、交叉学科等12个学科门类。另外，还有31个专业学位授权类别，其中15个可授予博士硕士学位，16个可授予硕士学位。
截至2018年3月，清华大学共有21个一级学科国家重点学科和6个二级学科国家重点学科，其中一级学科国家重点学科数居全国首位。此外，还有3个交叉学科北京市重点学科、5个一级学科北京市重点学科和8个二级学科北京市重点学科。